Thématique de Recherche:

Au sein de l'équipe Géomicrobiologie, je m'intéresse aux écosystèmes profonds, plus particulièrement aux sources de carbone qui permettent le développement de biofilms microbiens en subsurface. Mon travail se focalise ainsi sur deux types d'environnements profonds; (1) dans le cadre de mon projet de thèse, je cherche à caractériser la structure et la diversité des biofilms microbiens dans les environnements basaltiques profonds. Pour ce faire, je travaille en collaboration avec plusieurs membres de l'équipe sur des échantillons de basalte cristallin collectés lors d'un forage sur le site Hellisheidi (Islande). Ce dernier héberge une expérience à grande échelle de stockage minéral du CO₂, et représente une opportunité exceptionnelle pour nous d'étudier les effets de l'injection d'eau riche en carbone sur l'écosystème profond. Des biofilms ubiquistes, encore jamais décrits à cette profondeur, ont été observés dans les pores et fractures de la carotte. Notre objectif est donc d'étudier la diversité de ces communautés de biofilms et d'étudier leur corrélation avec la minéralogie et la chimie (organique et minérale) des roches le long de la carotte afin de mieux comprendre l'impact de l'injection de carbone sur la biosphère profonde. (2) Dans le cadre de la campagne océanographique ROV-SMOOTH sur la dorsale sud-ouest indienne, mon objectif va être de décrire les communautés microbiennes associées aux cheminées hydrothermales carbonatées du site Old city découvert lors de l'expédition. Le projet vise également à comprendre leur corrélation avec les différents processus d'altération et de minéralisation (carbonatation et serpentinisation), avec les flux d'eaux souterraines, et enfin avec les roches mantelliques (péridotites serpentinisées) qui composent le substratum sur ce site particluier.

Poste actuel:

• Doctorant- Equipe Géomicrobiologie, Institut de Physique du Globe de Paris - Sorbonne Paris Cité - Université Paris 7 Diderot, UFR STEP; "Biofilms microbiens dans les environnements basaltiques de subsurface: Etude de la diversité et de l'impact d'injections d'eau souterraine riche en CO2 " - Encadrantes: Bénédicte Ménez, Emmanuelle Gérard

Formation:

• Depuis Octobre 2016: Doctorant Terre et Environnement, IPGP, Université Paris Diderot 7 - Sorbonne Paris Cité - ED STEP'UP
• 2013-2015: M.Sc. Biologie Santé, sp. Microbiologie Fondamentale et Appliquée - Université de Bretagne Occidentale (UBO), Brest, France
• 2012-2013: B.Sc. Sciences de la Terre et de l'Environnement - Université de Perpignan via Domitia, Perpignan, France

Experiences dans le domaine de la recherche:

• Jan-Juin 2015: Masters visiting student - Bigelow Laboratory for Ocean Sciences, Deep Biosphere Lab., East Boothbay, ME, USA; "Microbes deep beneath the seafloor: Results from a 4-year in situ microbial observatory experiment" - Encadrant: Dr. Beth N. Orcutt
• Nov-Déc 2014: Stage de recherche - Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, UBO, Brest, France; "Microbial DNA from Canterbury Basin Rock Samples: Biases associated with incomplete nucleic acid extraction" - Encadrant: Dr. Loïs Maignien
• Jan-Mar 2014: Resarch intern - Institute of Arctic and Alpine Research (INSTAAR), Boulder, CO, USA; "Microbial Extracellular Enzyme Activity and Community Assembly Processes after Fire and Flood Disturbances" - Encadrants: Dr. Emily B. Graham & Dr. Joseph E. Knelman

Campagnes en Mer:

• 30 Nov. 2016- 5 Jan. 2017: Campagne océanographique ROV-SMOOTH, Dorsale Sud-Ouest Indienne, N/O Pourquoi Pas? - Responsable du conditionnement des échantillons de roches et de fluides pour les études d'écologie microbienne, de microscopie et de géochimie à terre.

• 25-30 Mar. 2015: ECOGIG 2 oceanographic lander cruise, expédition PE15-20, Nord du Golf du Mexique, R/V Pelican - Responsable de l'assemblage des Omosampler pour les sytèmes MIcrobial Methane Observatory for Seafloor Analysis (MIMOSA).

Publications

• Trias R, Ménez B, le Campion P, Zivanovic Y, Lecourt L, Lecoeuvre A, Schmitt-Kopplin P, Uhl J, Gislason SR, Alfreðsson HA, Mesfin KG, Snæbjörnsdóttir SÖ, Aradóttir ES, Gunnarsson I, Matter JM, Stute M, Oelkers EH, Gérard E (2017) High reactivity of deep biota under anthropogenic CO2 injection into basalt. Nature Communications doi: 10.1038/s41467-017-01288-8.
• Knelman, J., Graham, E., Ferrenberg, S., Lecoeuvre, A., Labrado, A., Darcy, J., et al. (2017). Rapid Shifts in Soil Nutrients and Decomposition Enzyme Activity in Early Succession Following Forest Fire. Forests 8, 347. doi:10.3390/f8090347.

Conférence et Symposium:

• Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne - "Structure et dynamique d'un consortium microbien issu d'un aquifère basaltique profond lors d'une injection de CO2 en subsurface simuléd en laboratoire" - Session poster

• Goldschmidt 2017, Paris, France - "Structure and Dynamics of a Basalt Hosted Subsurface Microbial Consortium Facing CO2-rich Groundwater in an Analogous Flow-Through Experiment" - Session poster.
• Bigelow Seminar Series, Bigelow Laboratory for Ocean Sciences, East Boothbay, ME, USA - "Microbes deep beneath the seafloor: Results from a 4-years microbial observatory experiment" - Présentation orale.
• NorthEastern Geobiology Symposium, Princeton University, NJ, USA - "Investigating marine deep biosphere geomicrobiology in young ocean crust using long-term subsurface observatories" - Session Poster.